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空间转录组技术是结合成像、生物标记、测序及生物信息学等工具对组织切片的基因表达进行空间定位的一项技术,可揭示各细胞类型在组织中的空间分布、各细胞群体间的相互作用以及绘制不同组织区域的基因表达图谱,对于理解疾病和癌症的发生机制,生命发育活动具有深远的应用价值。
百创智造于2022年4月25日推出超高分辨率(4.8μm,比国外技术提高400倍)空间转录芯片百创S1000以来,受到了市场的广泛好评与认可。经过又一年的研发沉淀,百创智造将技术回归生命科学本质,开创性的将样本原片荧光,原片H&E染色与原片高通量测序相结合,实现精准的细胞分割,实现以细胞为单位的空间转录测序。
2023年6月28日百创智造在山东青岛举办了百创智造S系列空间转录组细胞分割产品发布会。会上正式发布了基于百创S系列空间芯片的细胞分割技术,重新定义空间组学新标准,开启单细胞级空间转录组科研时代。
会上,百创智造副总裁刘敏介绍到,细胞是生命的基本单元,也是生命科学研究最通用的单位,但是现在常规的空间原位捕获测序技术还远远达不到这个水平,去准确得到单细胞级空间数据是非常有必要的,同时对于大家比较关心的问题-百创S系列空间芯片的细胞分割技术实现原理是什么?也做了详细介绍。
百创智造S系列空间转录组细胞分割实现原理-三图合一
百创智造基于S系列空间芯片的底层设计,开发出了自己的专利技术,可以得到完全没有错误的原片荧光图像以及H&E图像且与芯片完全对齐。然后基于荧光进行细胞核的定位刻画细胞核的边界,然后基于HE的校准辅助刻画细胞的边界,通过边界信息映射到芯片上,提取相应位置的测序数据,实现精准的单细胞分割。
同时,对于细胞类型差异大的片子以及植物样本,百创智造也匹配了免费的可视化软件BSTCellViewer,可以手动进行细胞的修改,圈定。
会上,与会专家就空间组学的发展,空间组学细胞分割技术的应用展开了热烈的讨论。
同时,对于百创S系列空间芯片细胞分割技术的部分测试数据要进行了展示,在动植物上都有出色的变现。